ファンタジー美少女麻雀ゲームの代名詞「麻雀幻想曲」シリーズ第二弾が、更にパワーアップして帰ってきました。
初心者から上級な人まで楽しめる役作りモード「トレーニングモード」、新たに描きおろされた美少女達が脱ぎ脱ぎしちゃう「対戦ぬぎぬぎモード」、そして、「麻雀幻想曲」シリーズで忘れてはならない「ストーリーモード」･･･過去に「麻雀幻想曲」シリーズをプレイしたことがある人も、そうでない人も、きっと楽しめる、ごっきげんな麻雀ゲーム、それが「麻雀幻想曲II -2001 EDITION-」なのです。
遠い遠い、遙か昔･･･。
人々が魔法を信じ、精霊達が地上に満ち溢れていた時代にこの物語は綴られた。
伝説の魔術師オーディンが時の魔法を使いて彼方から持ち帰りし百三十六個の石は「牌」と呼ばれ、剣に変わる新しい武器として人々に伝えられた･･･。
その格闘方法は麻雀と呼ばれ、これを期に流血を招く剣や魔法による戦いを見ることは少なくなっていった･･･。

いろいろな事件や事故が渦巻く大都会の中…。
世間に反発するような生活を送りながらも、ダンスの本場、アメリカの舞台に立ちたいという夢を持つ4人の若者。
彼らはダンスチーム『J-RAP』を組んで、レッスンに励む毎日である…。
主人公、小堀健介もそんなメンバーの一人。
ダンスやラップを愛する彼は、天才的ハッカーでもあった。
ある日、ダンスのコーチとして、飛び抜けたセンスの持ち主アン・ヘイワースが現れる。
ビジュアル的にも申し分なし。
そして彼女へのアプローチが始まる。
そんな矢先、健介は彼女の正体―――謎の組織“Gopher（ゴファー）”のアサシン（暗殺者）であることを知ってしまう…。

育ての親である祖父の死後、某学園の理事長・真知代に引き取られ、学生として某学園に通いながら、同時に学園の管理人も務めることになった主人公・琢馬。
学園では知らない者はいないという仲良し美少女3人組、面倒見が良いハズなのに、トボけた性格の養護の先生。
威勢のいいお調子者の友人など、個性的な面々に囲まれ、涙あり、笑いあり、甘くて苦い？恋模様あり…の、日常が繰り広げられていきます。
ゲームの期間は、5月～8月までの3ヶ月間。
ラストシーンで主人公の隣では、どの娘が微笑んでいるのでしょうか…。